Działalność Samorządu Uczniowskiego w szkole określa regulamin Samorządu Uczniowskiego Specjalnego Ośrodka Szkolno – Wychowawczego im. św. Jana Pawła II w Leżajsku zawarty w statucie ośrodka.
Samorząd Uczniowski wybierany jest w ogólnoszkolnych wyborach we wrześniu każdego roku szkolnego i jego kadencja trwa jeden rok. Kandydat do wyborów – musi uczęszczać przynajmniej do czwartej klasy oraz uzyskać pozytywną opinię wychowawcy klasy i grupy.
W skład samorządu uczniowskiego wchodzą: przewodniczący, zastępca oraz powoływane są dwie sekcje: kulturalno-porządkowa oraz artystyczno-dekoratorska.
Przewodniczącym Samorządu Uczniowskiego zostaje osoba, która otrzymała największą liczbę głosów w głosowaniu, zastępcą zostaje osoba, która otrzymała drugą w kolejności liczbę głosów.
Samorząd Uczniowski z pomocą opiekunów podejmuje różne działania na rzecz placówki we współpracy z organizacjami szkolnymi, środowiskiem lokalnym. Podejmowane działania mają na celu kształtowanie wśród uczniów postaw prospołecznych, poczucia sprawstwa, odpowiedzialności, budowania pozytywnego obrazu siebie oraz pozytywnej samooceny.
Działalność uczniów w Samorządzie Uczniowskim jest okazją do odkrywania przez nich swoich talentów, nabywania różnych umiejętności potrzebnych w codziennym życiu, dzielenia się z innymi, tym, co wiedzą i potrafią. Uczniowie mają możliwość budowania systemu wartości tak ważnych w życiu, m.in.: dobro, prawda, piękno otaczającego świata, zdrowie, życie, rodzina, przyjaźń, pokój, praca, szacunek, pomoc, wsparcie, współpraca.